該項(xiàng)目類(lèi)似于繪制出人類(lèi)完整基因圖譜的人類(lèi)基因計(jì)劃。

盡管如此，人腦活動(dòng)圖項(xiàng)目仍遭到一些批評(píng)者們的反對(duì)。他們認(rèn)為，政府不應(yīng)該在單獨(dú)一個(gè)項(xiàng)目上投入重資，更何況該項(xiàng)目還缺乏明確目標(biāo)。
 
美國(guó)《大西洋月刊》引用網(wǎng)民的話，對(duì)“人腦活動(dòng)圖項(xiàng)目的目標(biāo)是否能夠得以實(shí)現(xiàn)、該項(xiàng)目是否最大限度地利用了聯(lián)邦資源”表示質(zhì)疑。
 
美國(guó)生物學(xué)家邁克爾·愛(ài)森說(shuō)：“必須有人站出來(lái)給國(guó)會(huì)議員們解釋基礎(chǔ)研究的重要性，而不是迎合他們的口味提出耗資巨大的科學(xué)項(xiàng)目?！?br/>  
《大西洋月刊》稱，愛(ài)森曾參加“DNA元素百科全書(shū)”項(xiàng)目（簡(jiǎn)稱ENCODE），并在此后一直反對(duì)“重大科研”項(xiàng)目。他在博客中寫(xiě)道：“ENCODE給我的教訓(xùn)是，這種大型項(xiàng)目并不是個(gè)好主意。大型生物項(xiàng)目并不利于以個(gè)人探索發(fā)現(xiàn)為動(dòng)力的科學(xué)的發(fā)展?！?br/>  
（來(lái)源：中國(guó)日?qǐng)?bào)網(wǎng) 信蓮 編輯：周鳳梅）